Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYCP1Q15431 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYCP1Q15431 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYCP1Q15431 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYCP1Q15431 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYCP1Q15431 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYCP1Q15431 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SYCP1Q15431 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYCP1Q15431 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYCP1Q15431 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYCP1Q15431 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYCP1Q15431 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYCP1Q15431 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYCP1Q15431 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYCP1Q15431 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYCP1Q15431 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYCP1Q15431 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYCP1Q15431 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYCP1Q15431 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYCP1Q15431 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYCP1Q15431 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYCP1Q15431 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYCP1Q15431 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYCP1Q15431 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYCP1Q15431 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYCP1Q15431 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYCP1Q15431 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYCP1Q15431 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYCP1Q15431 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYCP1Q15431 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYCP1Q15431 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYCP1Q15431 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYCP1Q15431 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYCP1Q15431 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYCP1Q15431 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYCP1Q15431 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYCP1Q15431 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYCP1Q15431 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYCP1Q15431 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYCP1Q15431 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYCP1Q15431 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYCP1Q15431 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYCP1Q15431 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYCP1Q15431 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYCP1Q15431 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYCP1Q15431 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
SYCP1Q15431 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SYCP1Q15431 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.03
SYCP1Q15431 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYCP1Q15431 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYCP1Q15431 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYCP1Q15431 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYCP1Q15431 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYCP1Q15431 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYCP1Q15431 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYCP1Q15431 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYCP1Q15431 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYCP1Q15431 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYCP1Q15431 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYCP1Q15431 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYCP1Q15431 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYCP1Q15431 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYCP1Q15431 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYCP1Q15431 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYCP1Q15431 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYCP1Q15431 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYCP1Q15431 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYCP1Q15431 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYCP1Q15431 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYCP1Q15431 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYCP1Q15431 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYCP1Q15431 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYCP1Q15431 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYCP1Q15431 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYCP1Q15431 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYCP1Q15431 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYCP1Q15431 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYCP1Q15431 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYCP1Q15431 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYCP1Q15431 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYCP1Q15431 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYCP1Q15431 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYCP1Q15431 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYCP1Q15431 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYCP1Q15431 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYCP1Q15431 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYCP1Q15431 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYCP1Q15431 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYCP1Q15431 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYCP1Q15431 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYCP1Q15431 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYCP1Q15431 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYCP1Q15431 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYCP1Q15431 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYCP1Q15431 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYCP1Q15431 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYCP1Q15431 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYCP1Q15431 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYCP1Q15431 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYCP1Q15431 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
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