Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NECTIN1Q15223 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NECTIN1Q15223 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NECTIN1Q15223 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NECTIN1Q15223 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NECTIN1Q15223 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NECTIN1Q15223 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NECTIN1Q15223 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NECTIN1Q15223 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NECTIN1Q15223 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NECTIN1Q15223 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NECTIN1Q15223 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NECTIN1Q15223 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NECTIN1Q15223 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NECTIN1Q15223 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NECTIN1Q15223 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NECTIN1Q15223 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NECTIN1Q15223 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NECTIN1Q15223 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NECTIN1Q15223 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NECTIN1Q15223 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NECTIN1Q15223 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NECTIN1Q15223 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NECTIN1Q15223 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NECTIN1Q15223 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NECTIN1Q15223 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NECTIN1Q15223 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NECTIN1Q15223 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NECTIN1Q15223 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NECTIN1Q15223 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NECTIN1Q15223 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NECTIN1Q15223 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NECTIN1Q15223 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NECTIN1Q15223 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NECTIN1Q15223 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NECTIN1Q15223 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NECTIN1Q15223 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NECTIN1Q15223 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NECTIN1Q15223 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NECTIN1Q15223 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NECTIN1Q15223 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NECTIN1Q15223 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NECTIN1Q15223 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NECTIN1Q15223 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NECTIN1Q15223 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NECTIN1Q15223 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NECTIN1Q15223 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NECTIN1Q15223 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NECTIN1Q15223 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NECTIN1Q15223 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NECTIN1Q15223 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NECTIN1Q15223 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NECTIN1Q15223 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NECTIN1Q15223 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NECTIN1Q15223 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NECTIN1Q15223 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NECTIN1Q15223 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NECTIN1Q15223 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NECTIN1Q15223 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NECTIN1Q15223 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NECTIN1Q15223 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NECTIN1Q15223 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NECTIN1Q15223 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NECTIN1Q15223 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NECTIN1Q15223 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NECTIN1Q15223 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NECTIN1Q15223 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NECTIN1Q15223 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NECTIN1Q15223 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NECTIN1Q15223 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NECTIN1Q15223 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NECTIN1Q15223 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NECTIN1Q15223 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NECTIN1Q15223 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NECTIN1Q15223 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NECTIN1Q15223 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
NECTIN1Q15223 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NECTIN1Q15223 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NECTIN1Q15223 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NECTIN1Q15223 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NECTIN1Q15223 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NECTIN1Q15223 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NECTIN1Q15223 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NECTIN1Q15223 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NECTIN1Q15223 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NECTIN1Q15223 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NECTIN1Q15223 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NECTIN1Q15223 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NECTIN1Q15223 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NECTIN1Q15223 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NECTIN1Q15223 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NECTIN1Q15223 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NECTIN1Q15223 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NECTIN1Q15223 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NECTIN1Q15223 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NECTIN1Q15223 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NECTIN1Q15223 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NECTIN1Q15223 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NECTIN1Q15223 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NECTIN1Q15223 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
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