Protein–RNA interactions for Protein: Q15139

PRKD1, Serine/threonine-protein kinase D1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD1Q15139 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PRKD1Q15139 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PRKD1Q15139 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PRKD1Q15139 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PRKD1Q15139 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PRKD1Q15139 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PRKD1Q15139 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PRKD1Q15139 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PRKD1Q15139 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PRKD1Q15139 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PRKD1Q15139 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PRKD1Q15139 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PRKD1Q15139 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PRKD1Q15139 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PRKD1Q15139 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PRKD1Q15139 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
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PRKD1Q15139 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PRKD1Q15139 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PRKD1Q15139 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PRKD1Q15139 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PRKD1Q15139 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PRKD1Q15139 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PRKD1Q15139 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
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PRKD1Q15139 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PRKD1Q15139 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PRKD1Q15139 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PRKD1Q15139 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PRKD1Q15139 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PRKD1Q15139 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PRKD1Q15139 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PRKD1Q15139 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PRKD1Q15139 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
PRKD1Q15139 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PRKD1Q15139 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PRKD1Q15139 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PRKD1Q15139 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PRKD1Q15139 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PRKD1Q15139 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PRKD1Q15139 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PRKD1Q15139 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PRKD1Q15139 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PRKD1Q15139 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PRKD1Q15139 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PRKD1Q15139 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PRKD1Q15139 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PRKD1Q15139 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PRKD1Q15139 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PRKD1Q15139 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
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