Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

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Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB3GAP1Q15042 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB3GAP1Q15042 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB3GAP1Q15042 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB3GAP1Q15042 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB3GAP1Q15042 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB3GAP1Q15042 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB3GAP1Q15042 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB3GAP1Q15042 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB3GAP1Q15042 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB3GAP1Q15042 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB3GAP1Q15042 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB3GAP1Q15042 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB3GAP1Q15042 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB3GAP1Q15042 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB3GAP1Q15042 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB3GAP1Q15042 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB3GAP1Q15042 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB3GAP1Q15042 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB3GAP1Q15042 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB3GAP1Q15042 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB3GAP1Q15042 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB3GAP1Q15042 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB3GAP1Q15042 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB3GAP1Q15042 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB3GAP1Q15042 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB3GAP1Q15042 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB3GAP1Q15042 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB3GAP1Q15042 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB3GAP1Q15042 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB3GAP1Q15042 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB3GAP1Q15042 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB3GAP1Q15042 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB3GAP1Q15042 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB3GAP1Q15042 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB3GAP1Q15042 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB3GAP1Q15042 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB3GAP1Q15042 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB3GAP1Q15042 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB3GAP1Q15042 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB3GAP1Q15042 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB3GAP1Q15042 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB3GAP1Q15042 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB3GAP1Q15042 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB3GAP1Q15042 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB3GAP1Q15042 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB3GAP1Q15042 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB3GAP1Q15042 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB3GAP1Q15042 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB3GAP1Q15042 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB3GAP1Q15042 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB3GAP1Q15042 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB3GAP1Q15042 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB3GAP1Q15042 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB3GAP1Q15042 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB3GAP1Q15042 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB3GAP1Q15042 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB3GAP1Q15042 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB3GAP1Q15042 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB3GAP1Q15042 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB3GAP1Q15042 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB3GAP1Q15042 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB3GAP1Q15042 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB3GAP1Q15042 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB3GAP1Q15042 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB3GAP1Q15042 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB3GAP1Q15042 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB3GAP1Q15042 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB3GAP1Q15042 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB3GAP1Q15042 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB3GAP1Q15042 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB3GAP1Q15042 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB3GAP1Q15042 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB3GAP1Q15042 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB3GAP1Q15042 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB3GAP1Q15042 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB3GAP1Q15042 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB3GAP1Q15042 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB3GAP1Q15042 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB3GAP1Q15042 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB3GAP1Q15042 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB3GAP1Q15042 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB3GAP1Q15042 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB3GAP1Q15042 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB3GAP1Q15042 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB3GAP1Q15042 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB3GAP1Q15042 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB3GAP1Q15042 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB3GAP1Q15042 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB3GAP1Q15042 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB3GAP1Q15042 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB3GAP1Q15042 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB3GAP1Q15042 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB3GAP1Q15042 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB3GAP1Q15042 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB3GAP1Q15042 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB3GAP1Q15042 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB3GAP1Q15042 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB3GAP1Q15042 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB3GAP1Q15042 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
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