Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SHPRHQ149N8 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SHPRHQ149N8 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SHPRHQ149N8 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SHPRHQ149N8 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SHPRHQ149N8 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SHPRHQ149N8 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SHPRHQ149N8 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SHPRHQ149N8 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SHPRHQ149N8 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SHPRHQ149N8 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SHPRHQ149N8 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SHPRHQ149N8 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SHPRHQ149N8 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SHPRHQ149N8 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SHPRHQ149N8 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SHPRHQ149N8 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SHPRHQ149N8 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SHPRHQ149N8 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SHPRHQ149N8 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SHPRHQ149N8 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SHPRHQ149N8 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SHPRHQ149N8 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SHPRHQ149N8 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SHPRHQ149N8 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SHPRHQ149N8 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SHPRHQ149N8 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SHPRHQ149N8 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SHPRHQ149N8 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SHPRHQ149N8 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SHPRHQ149N8 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SHPRHQ149N8 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SHPRHQ149N8 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SHPRHQ149N8 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SHPRHQ149N8 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SHPRHQ149N8 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SHPRHQ149N8 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SHPRHQ149N8 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SHPRHQ149N8 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SHPRHQ149N8 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SHPRHQ149N8 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SHPRHQ149N8 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SHPRHQ149N8 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SHPRHQ149N8 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SHPRHQ149N8 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SHPRHQ149N8 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SHPRHQ149N8 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SHPRHQ149N8 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SHPRHQ149N8 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SHPRHQ149N8 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SHPRHQ149N8 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SHPRHQ149N8 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SHPRHQ149N8 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SHPRHQ149N8 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SHPRHQ149N8 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SHPRHQ149N8 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SHPRHQ149N8 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SHPRHQ149N8 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SHPRHQ149N8 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SHPRHQ149N8 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SHPRHQ149N8 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SHPRHQ149N8 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SHPRHQ149N8 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SHPRHQ149N8 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SHPRHQ149N8 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SHPRHQ149N8 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SHPRHQ149N8 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SHPRHQ149N8 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SHPRHQ149N8 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SHPRHQ149N8 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SHPRHQ149N8 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SHPRHQ149N8 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SHPRHQ149N8 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SHPRHQ149N8 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SHPRHQ149N8 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SHPRHQ149N8 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SHPRHQ149N8 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SHPRHQ149N8 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SHPRHQ149N8 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SHPRHQ149N8 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SHPRHQ149N8 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SHPRHQ149N8 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SHPRHQ149N8 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SHPRHQ149N8 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SHPRHQ149N8 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SHPRHQ149N8 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SHPRHQ149N8 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SHPRHQ149N8 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SHPRHQ149N8 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SHPRHQ149N8 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SHPRHQ149N8 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SHPRHQ149N8 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SHPRHQ149N8 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SHPRHQ149N8 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SHPRHQ149N8 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SHPRHQ149N8 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SHPRHQ149N8 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SHPRHQ149N8 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SHPRHQ149N8 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SHPRHQ149N8 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
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