Protein–RNA interactions for Protein: Q14534

SQLE, Squalene monooxygenase, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQLEQ14534 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SQLEQ14534 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SQLEQ14534 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SQLEQ14534 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SQLEQ14534 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SQLEQ14534 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SQLEQ14534 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SQLEQ14534 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SQLEQ14534 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SQLEQ14534 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SQLEQ14534 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SQLEQ14534 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SQLEQ14534 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SQLEQ14534 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SQLEQ14534 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SQLEQ14534 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SQLEQ14534 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SQLEQ14534 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SQLEQ14534 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SQLEQ14534 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SQLEQ14534 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SQLEQ14534 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SQLEQ14534 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SQLEQ14534 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SQLEQ14534 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SQLEQ14534 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SQLEQ14534 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SQLEQ14534 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SQLEQ14534 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SQLEQ14534 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SQLEQ14534 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SQLEQ14534 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SQLEQ14534 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SQLEQ14534 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SQLEQ14534 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SQLEQ14534 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SQLEQ14534 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SQLEQ14534 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SQLEQ14534 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SQLEQ14534 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SQLEQ14534 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SQLEQ14534 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SQLEQ14534 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SQLEQ14534 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SQLEQ14534 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SQLEQ14534 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SQLEQ14534 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SQLEQ14534 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SQLEQ14534 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SQLEQ14534 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SQLEQ14534 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SQLEQ14534 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SQLEQ14534 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SQLEQ14534 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SQLEQ14534 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SQLEQ14534 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SQLEQ14534 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SQLEQ14534 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SQLEQ14534 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SQLEQ14534 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SQLEQ14534 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SQLEQ14534 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SQLEQ14534 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SQLEQ14534 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SQLEQ14534 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SQLEQ14534 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SQLEQ14534 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SQLEQ14534 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SQLEQ14534 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SQLEQ14534 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SQLEQ14534 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SQLEQ14534 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SQLEQ14534 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
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