Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

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Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
CKAP5Q14008 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CKAP5Q14008 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CKAP5Q14008 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CKAP5Q14008 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
CKAP5Q14008 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CKAP5Q14008 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CKAP5Q14008 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
CKAP5Q14008 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
CKAP5Q14008 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
CKAP5Q14008 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
CKAP5Q14008 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
CKAP5Q14008 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
CKAP5Q14008 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
CKAP5Q14008 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CKAP5Q14008 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CKAP5Q14008 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CKAP5Q14008 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CKAP5Q14008 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CKAP5Q14008 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CKAP5Q14008 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CKAP5Q14008 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CKAP5Q14008 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CKAP5Q14008 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CKAP5Q14008 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CKAP5Q14008 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CKAP5Q14008 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CKAP5Q14008 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CKAP5Q14008 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CKAP5Q14008 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CKAP5Q14008 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
CKAP5Q14008 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CKAP5Q14008 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CKAP5Q14008 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CKAP5Q14008 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CKAP5Q14008 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CKAP5Q14008 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CKAP5Q14008 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CKAP5Q14008 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CKAP5Q14008 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CKAP5Q14008 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CKAP5Q14008 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
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CKAP5Q14008 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
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CKAP5Q14008 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CKAP5Q14008 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CKAP5Q14008 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CKAP5Q14008 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CKAP5Q14008 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CKAP5Q14008 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
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CKAP5Q14008 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
CKAP5Q14008 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
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CKAP5Q14008 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
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CKAP5Q14008 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CKAP5Q14008 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CKAP5Q14008 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CKAP5Q14008 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CKAP5Q14008 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
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CKAP5Q14008 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
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CKAP5Q14008 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CKAP5Q14008 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
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CKAP5Q14008 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CKAP5Q14008 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CKAP5Q14008 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CKAP5Q14008 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CKAP5Q14008 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CKAP5Q14008 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CKAP5Q14008 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CKAP5Q14008 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CKAP5Q14008 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CKAP5Q14008 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CKAP5Q14008 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CKAP5Q14008 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CKAP5Q14008 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CKAP5Q14008 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CKAP5Q14008 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CKAP5Q14008 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CKAP5Q14008 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CKAP5Q14008 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CKAP5Q14008 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CKAP5Q14008 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CKAP5Q14008 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CKAP5Q14008 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CKAP5Q14008 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
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