Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGA9Q13797 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGA9Q13797 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGA9Q13797 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGA9Q13797 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGA9Q13797 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGA9Q13797 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGA9Q13797 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGA9Q13797 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGA9Q13797 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGA9Q13797 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGA9Q13797 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGA9Q13797 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGA9Q13797 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGA9Q13797 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ITGA9Q13797 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ITGA9Q13797 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ITGA9Q13797 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ITGA9Q13797 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ITGA9Q13797 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ITGA9Q13797 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ITGA9Q13797 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ITGA9Q13797 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
ITGA9Q13797 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ITGA9Q13797 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ITGA9Q13797 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ITGA9Q13797 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ITGA9Q13797 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ITGA9Q13797 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ITGA9Q13797 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
ITGA9Q13797 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ITGA9Q13797 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ITGA9Q13797 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ITGA9Q13797 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ITGA9Q13797 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ITGA9Q13797 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGA9Q13797 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGA9Q13797 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGA9Q13797 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGA9Q13797 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGA9Q13797 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGA9Q13797 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGA9Q13797 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGA9Q13797 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGA9Q13797 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGA9Q13797 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGA9Q13797 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGA9Q13797 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGA9Q13797 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGA9Q13797 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGA9Q13797 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGA9Q13797 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGA9Q13797 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGA9Q13797 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGA9Q13797 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGA9Q13797 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGA9Q13797 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGA9Q13797 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGA9Q13797 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGA9Q13797 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGA9Q13797 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGA9Q13797 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGA9Q13797 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGA9Q13797 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGA9Q13797 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGA9Q13797 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGA9Q13797 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGA9Q13797 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGA9Q13797 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGA9Q13797 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGA9Q13797 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGA9Q13797 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGA9Q13797 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGA9Q13797 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGA9Q13797 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGA9Q13797 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGA9Q13797 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGA9Q13797 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGA9Q13797 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGA9Q13797 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGA9Q13797 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGA9Q13797 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGA9Q13797 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGA9Q13797 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGA9Q13797 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGA9Q13797 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGA9Q13797 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGA9Q13797 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGA9Q13797 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGA9Q13797 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGA9Q13797 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGA9Q13797 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGA9Q13797 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGA9Q13797 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGA9Q13797 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGA9Q13797 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGA9Q13797 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGA9Q13797 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGA9Q13797 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGA9Q13797 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms