Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBA3CQ13748 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBA3CQ13748 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBA3CQ13748 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBA3CQ13748 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBA3CQ13748 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBA3CQ13748 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBA3CQ13748 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBA3CQ13748 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBA3CQ13748 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBA3CQ13748 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBA3CQ13748 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBA3CQ13748 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBA3CQ13748 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBA3CQ13748 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBA3CQ13748 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBA3CQ13748 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBA3CQ13748 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBA3CQ13748 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBA3CQ13748 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBA3CQ13748 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBA3CQ13748 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBA3CQ13748 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBA3CQ13748 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBA3CQ13748 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBA3CQ13748 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBA3CQ13748 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBA3CQ13748 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TUBA3CQ13748 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TUBA3CQ13748 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TUBA3CQ13748 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TUBA3CQ13748 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TUBA3CQ13748 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TUBA3CQ13748 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TUBA3CQ13748 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TUBA3CQ13748 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TUBA3CQ13748 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TUBA3CQ13748 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TUBA3CQ13748 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TUBA3CQ13748 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TUBA3CQ13748 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TUBA3CQ13748 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TUBA3CQ13748 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TUBA3CQ13748 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TUBA3CQ13748 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TUBA3CQ13748 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TUBA3CQ13748 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TUBA3CQ13748 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TUBA3CQ13748 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TUBA3CQ13748 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TUBA3CQ13748 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TUBA3CQ13748 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TUBA3CQ13748 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TUBA3CQ13748 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TUBA3CQ13748 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBA3CQ13748 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBA3CQ13748 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBA3CQ13748 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBA3CQ13748 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBA3CQ13748 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBA3CQ13748 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBA3CQ13748 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBA3CQ13748 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBA3CQ13748 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBA3CQ13748 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
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TUBA3CQ13748 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBA3CQ13748 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBA3CQ13748 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBA3CQ13748 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBA3CQ13748 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBA3CQ13748 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBA3CQ13748 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBA3CQ13748 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBA3CQ13748 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBA3CQ13748 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBA3CQ13748 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBA3CQ13748 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBA3CQ13748 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBA3CQ13748 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBA3CQ13748 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBA3CQ13748 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBA3CQ13748 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBA3CQ13748 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBA3CQ13748 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBA3CQ13748 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBA3CQ13748 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBA3CQ13748 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBA3CQ13748 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBA3CQ13748 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBA3CQ13748 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBA3CQ13748 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBA3CQ13748 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBA3CQ13748 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBA3CQ13748 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBA3CQ13748 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
TUBA3CQ13748 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
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