Protein–RNA interactions for Protein: Q13609

DNASE1L3, Deoxyribonuclease gamma, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNASE1L3Q13609 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DNASE1L3Q13609 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
DNASE1L3Q13609 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DNASE1L3Q13609 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
DNASE1L3Q13609 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
DNASE1L3Q13609 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
DNASE1L3Q13609 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DNASE1L3Q13609 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
DNASE1L3Q13609 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DNASE1L3Q13609 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
DNASE1L3Q13609 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DNASE1L3Q13609 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
DNASE1L3Q13609 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DNASE1L3Q13609 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
DNASE1L3Q13609 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
DNASE1L3Q13609 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DNASE1L3Q13609 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
DNASE1L3Q13609 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
DNASE1L3Q13609 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
DNASE1L3Q13609 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DNASE1L3Q13609 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DNASE1L3Q13609 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DNASE1L3Q13609 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DNASE1L3Q13609 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DNASE1L3Q13609 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DNASE1L3Q13609 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DNASE1L3Q13609 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DNASE1L3Q13609 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
DNASE1L3Q13609 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DNASE1L3Q13609 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
DNASE1L3Q13609 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DNASE1L3Q13609 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DNASE1L3Q13609 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DNASE1L3Q13609 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DNASE1L3Q13609 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DNASE1L3Q13609 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DNASE1L3Q13609 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DNASE1L3Q13609 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DNASE1L3Q13609 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DNASE1L3Q13609 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.58
DNASE1L3Q13609 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
DNASE1L3Q13609 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DNASE1L3Q13609 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DNASE1L3Q13609 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DNASE1L3Q13609 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DNASE1L3Q13609 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
DNASE1L3Q13609 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DNASE1L3Q13609 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DNASE1L3Q13609 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DNASE1L3Q13609 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DNASE1L3Q13609 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DNASE1L3Q13609 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DNASE1L3Q13609 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DNASE1L3Q13609 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
DNASE1L3Q13609 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DNASE1L3Q13609 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DNASE1L3Q13609 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DNASE1L3Q13609 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DNASE1L3Q13609 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DNASE1L3Q13609 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DNASE1L3Q13609 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DNASE1L3Q13609 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DNASE1L3Q13609 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DNASE1L3Q13609 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DNASE1L3Q13609 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DNASE1L3Q13609 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DNASE1L3Q13609 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DNASE1L3Q13609 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DNASE1L3Q13609 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DNASE1L3Q13609 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DNASE1L3Q13609 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DNASE1L3Q13609 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DNASE1L3Q13609 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DNASE1L3Q13609 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DNASE1L3Q13609 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DNASE1L3Q13609 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DNASE1L3Q13609 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DNASE1L3Q13609 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DNASE1L3Q13609 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DNASE1L3Q13609 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
DNASE1L3Q13609 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DNASE1L3Q13609 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
DNASE1L3Q13609 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DNASE1L3Q13609 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DNASE1L3Q13609 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DNASE1L3Q13609 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DNASE1L3Q13609 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DNASE1L3Q13609 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
DNASE1L3Q13609 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DNASE1L3Q13609 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DNASE1L3Q13609 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DNASE1L3Q13609 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DNASE1L3Q13609 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DNASE1L3Q13609 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DNASE1L3Q13609 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
DNASE1L3Q13609 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DNASE1L3Q13609 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DNASE1L3Q13609 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
DNASE1L3Q13609 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DNASE1L3Q13609 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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