Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

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Length 534 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NAE1Q13564 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NAE1Q13564 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NAE1Q13564 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NAE1Q13564 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NAE1Q13564 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NAE1Q13564 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NAE1Q13564 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NAE1Q13564 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NAE1Q13564 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NAE1Q13564 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NAE1Q13564 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NAE1Q13564 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NAE1Q13564 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NAE1Q13564 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NAE1Q13564 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NAE1Q13564 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NAE1Q13564 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NAE1Q13564 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NAE1Q13564 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NAE1Q13564 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NAE1Q13564 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NAE1Q13564 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NAE1Q13564 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NAE1Q13564 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NAE1Q13564 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
NAE1Q13564 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NAE1Q13564 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NAE1Q13564 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NAE1Q13564 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NAE1Q13564 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NAE1Q13564 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NAE1Q13564 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NAE1Q13564 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NAE1Q13564 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NAE1Q13564 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NAE1Q13564 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
NAE1Q13564 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NAE1Q13564 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
NAE1Q13564 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NAE1Q13564 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NAE1Q13564 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NAE1Q13564 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NAE1Q13564 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NAE1Q13564 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
NAE1Q13564 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NAE1Q13564 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NAE1Q13564 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NAE1Q13564 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NAE1Q13564 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NAE1Q13564 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NAE1Q13564 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NAE1Q13564 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NAE1Q13564 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
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NAE1Q13564 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NAE1Q13564 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NAE1Q13564 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NAE1Q13564 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NAE1Q13564 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NAE1Q13564 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NAE1Q13564 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NAE1Q13564 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NAE1Q13564 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NAE1Q13564 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
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NAE1Q13564 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NAE1Q13564 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NAE1Q13564 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NAE1Q13564 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NAE1Q13564 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NAE1Q13564 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NAE1Q13564 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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NAE1Q13564 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NAE1Q13564 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NAE1Q13564 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NAE1Q13564 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NAE1Q13564 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NAE1Q13564 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NAE1Q13564 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NAE1Q13564 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NAE1Q13564 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NAE1Q13564 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NAE1Q13564 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NAE1Q13564 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NAE1Q13564 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NAE1Q13564 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NAE1Q13564 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NAE1Q13564 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NAE1Q13564 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
NAE1Q13564 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NAE1Q13564 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NAE1Q13564 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NAE1Q13564 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NAE1Q13564 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NAE1Q13564 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NAE1Q13564 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NAE1Q13564 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NAE1Q13564 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
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