Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA3FQ13275 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA3FQ13275 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA3FQ13275 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA3FQ13275 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA3FQ13275 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA3FQ13275 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA3FQ13275 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA3FQ13275 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA3FQ13275 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA3FQ13275 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA3FQ13275 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA3FQ13275 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA3FQ13275 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA3FQ13275 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA3FQ13275 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA3FQ13275 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA3FQ13275 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA3FQ13275 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA3FQ13275 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA3FQ13275 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA3FQ13275 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA3FQ13275 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA3FQ13275 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA3FQ13275 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA3FQ13275 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA3FQ13275 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA3FQ13275 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEMA3FQ13275 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEMA3FQ13275 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEMA3FQ13275 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEMA3FQ13275 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEMA3FQ13275 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEMA3FQ13275 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEMA3FQ13275 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEMA3FQ13275 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEMA3FQ13275 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEMA3FQ13275 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEMA3FQ13275 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEMA3FQ13275 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SEMA3FQ13275 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEMA3FQ13275 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEMA3FQ13275 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEMA3FQ13275 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEMA3FQ13275 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEMA3FQ13275 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEMA3FQ13275 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEMA3FQ13275 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA3FQ13275 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA3FQ13275 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA3FQ13275 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA3FQ13275 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA3FQ13275 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA3FQ13275 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA3FQ13275 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA3FQ13275 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA3FQ13275 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA3FQ13275 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA3FQ13275 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA3FQ13275 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA3FQ13275 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA3FQ13275 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA3FQ13275 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA3FQ13275 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA3FQ13275 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA3FQ13275 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA3FQ13275 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA3FQ13275 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA3FQ13275 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA3FQ13275 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA3FQ13275 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SEMA3FQ13275 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SEMA3FQ13275 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SEMA3FQ13275 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SEMA3FQ13275 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SEMA3FQ13275 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SEMA3FQ13275 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SEMA3FQ13275 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SEMA3FQ13275 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SEMA3FQ13275 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SEMA3FQ13275 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SEMA3FQ13275 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SEMA3FQ13275 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SEMA3FQ13275 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
SEMA3FQ13275 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SEMA3FQ13275 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SEMA3FQ13275 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SEMA3FQ13275 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SEMA3FQ13275 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SEMA3FQ13275 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SEMA3FQ13275 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEMA3FQ13275 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEMA3FQ13275 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEMA3FQ13275 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEMA3FQ13275 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEMA3FQ13275 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEMA3FQ13275 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEMA3FQ13275 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SEMA3FQ13275 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEMA3FQ13275 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
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