Protein–RNA interactions for Protein: Q13131

PRKAA1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAA1Q13131 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRKAA1Q13131 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PRKAA1Q13131 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRKAA1Q13131 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRKAA1Q13131 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRKAA1Q13131 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRKAA1Q13131 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRKAA1Q13131 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PRKAA1Q13131 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRKAA1Q13131 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRKAA1Q13131 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRKAA1Q13131 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRKAA1Q13131 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRKAA1Q13131 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRKAA1Q13131 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PRKAA1Q13131 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRKAA1Q13131 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRKAA1Q13131 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PRKAA1Q13131 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRKAA1Q13131 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRKAA1Q13131 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRKAA1Q13131 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRKAA1Q13131 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRKAA1Q13131 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PRKAA1Q13131 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRKAA1Q13131 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRKAA1Q13131 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRKAA1Q13131 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRKAA1Q13131 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRKAA1Q13131 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRKAA1Q13131 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRKAA1Q13131 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PRKAA1Q13131 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRKAA1Q13131 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRKAA1Q13131 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRKAA1Q13131 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRKAA1Q13131 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRKAA1Q13131 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRKAA1Q13131 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRKAA1Q13131 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRKAA1Q13131 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRKAA1Q13131 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRKAA1Q13131 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRKAA1Q13131 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRKAA1Q13131 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRKAA1Q13131 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRKAA1Q13131 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRKAA1Q13131 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRKAA1Q13131 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRKAA1Q13131 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRKAA1Q13131 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRKAA1Q13131 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRKAA1Q13131 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRKAA1Q13131 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
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PRKAA1Q13131 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRKAA1Q13131 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRKAA1Q13131 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRKAA1Q13131 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
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PRKAA1Q13131 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
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PRKAA1Q13131 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRKAA1Q13131 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
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PRKAA1Q13131 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
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PRKAA1Q13131 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRKAA1Q13131 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRKAA1Q13131 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRKAA1Q13131 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRKAA1Q13131 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRKAA1Q13131 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
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PRKAA1Q13131 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
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PRKAA1Q13131 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRKAA1Q13131 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PRKAA1Q13131 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRKAA1Q13131 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRKAA1Q13131 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRKAA1Q13131 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRKAA1Q13131 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRKAA1Q13131 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRKAA1Q13131 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRKAA1Q13131 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRKAA1Q13131 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRKAA1Q13131 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRKAA1Q13131 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRKAA1Q13131 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
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PRKAA1Q13131 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
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