Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
MRPL28Q13084 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms