Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAF1Q13077 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAF1Q13077 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAF1Q13077 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAF1Q13077 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAF1Q13077 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAF1Q13077 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAF1Q13077 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAF1Q13077 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAF1Q13077 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAF1Q13077 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAF1Q13077 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAF1Q13077 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAF1Q13077 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAF1Q13077 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAF1Q13077 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAF1Q13077 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAF1Q13077 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAF1Q13077 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAF1Q13077 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAF1Q13077 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAF1Q13077 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAF1Q13077 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAF1Q13077 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAF1Q13077 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAF1Q13077 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAF1Q13077 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAF1Q13077 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAF1Q13077 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAF1Q13077 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAF1Q13077 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAF1Q13077 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAF1Q13077 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAF1Q13077 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAF1Q13077 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAF1Q13077 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAF1Q13077 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAF1Q13077 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAF1Q13077 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAF1Q13077 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAF1Q13077 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAF1Q13077 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAF1Q13077 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAF1Q13077 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAF1Q13077 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAF1Q13077 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRAF1Q13077 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRAF1Q13077 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRAF1Q13077 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRAF1Q13077 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRAF1Q13077 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRAF1Q13077 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRAF1Q13077 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
TRAF1Q13077 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAF1Q13077 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAF1Q13077 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAF1Q13077 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAF1Q13077 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAF1Q13077 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAF1Q13077 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAF1Q13077 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAF1Q13077 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAF1Q13077 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAF1Q13077 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAF1Q13077 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAF1Q13077 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAF1Q13077 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAF1Q13077 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAF1Q13077 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAF1Q13077 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAF1Q13077 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAF1Q13077 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
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TRAF1Q13077 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAF1Q13077 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAF1Q13077 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAF1Q13077 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAF1Q13077 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAF1Q13077 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAF1Q13077 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAF1Q13077 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAF1Q13077 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAF1Q13077 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAF1Q13077 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAF1Q13077 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAF1Q13077 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAF1Q13077 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAF1Q13077 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAF1Q13077 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAF1Q13077 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAF1Q13077 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAF1Q13077 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAF1Q13077 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAF1Q13077 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAF1Q13077 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAF1Q13077 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAF1Q13077 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAF1Q13077 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAF1Q13077 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAF1Q13077 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
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