Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
STRN3Q13033 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
STRN3Q13033 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
STRN3Q13033 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
STRN3Q13033 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
STRN3Q13033 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
STRN3Q13033 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
STRN3Q13033 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
STRN3Q13033 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
STRN3Q13033 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
STRN3Q13033 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
STRN3Q13033 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.29■■□□□ 1
STRN3Q13033 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
STRN3Q13033 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
STRN3Q13033 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
STRN3Q13033 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
STRN3Q13033 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.28■■□□□ 1
STRN3Q13033 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
STRN3Q13033 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
STRN3Q13033 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
STRN3Q13033 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
STRN3Q13033 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
STRN3Q13033 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
STRN3Q13033 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
STRN3Q13033 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
STRN3Q13033 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
STRN3Q13033 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
STRN3Q13033 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
STRN3Q13033 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC21.28■■□□□ 1
STRN3Q13033 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
STRN3Q13033 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
STRN3Q13033 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
STRN3Q13033 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
STRN3Q13033 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
STRN3Q13033 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC21.28■■□□□ 1
STRN3Q13033 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
STRN3Q13033 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
STRN3Q13033 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
STRN3Q13033 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.28■■□□□ 1
STRN3Q13033 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.28■■□□□ 1
STRN3Q13033 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
STRN3Q13033 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
STRN3Q13033 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.28■■□□□ 1
STRN3Q13033 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
STRN3Q13033 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
STRN3Q13033 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
STRN3Q13033 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
STRN3Q13033 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
STRN3Q13033 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
STRN3Q13033 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
STRN3Q13033 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
STRN3Q13033 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
STRN3Q13033 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
STRN3Q13033 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
STRN3Q13033 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
STRN3Q13033 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
STRN3Q13033 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC21.27■■□□□ 1
STRN3Q13033 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
STRN3Q13033 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
STRN3Q13033 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
STRN3Q13033 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
STRN3Q13033 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
STRN3Q13033 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
STRN3Q13033 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
STRN3Q13033 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
STRN3Q13033 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
STRN3Q13033 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
STRN3Q13033 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
STRN3Q13033 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
STRN3Q13033 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
STRN3Q13033 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
STRN3Q13033 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
STRN3Q13033 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
STRN3Q13033 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
STRN3Q13033 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
STRN3Q13033 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
STRN3Q13033 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
STRN3Q13033 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
STRN3Q13033 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
STRN3Q13033 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
STRN3Q13033 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
STRN3Q13033 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
STRN3Q13033 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
STRN3Q13033 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
STRN3Q13033 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
STRN3Q13033 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
STRN3Q13033 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
STRN3Q13033 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
STRN3Q13033 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
STRN3Q13033 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
STRN3Q13033 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
STRN3Q13033 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
STRN3Q13033 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
STRN3Q13033 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
STRN3Q13033 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
STRN3Q13033 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
STRN3Q13033 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
STRN3Q13033 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
STRN3Q13033 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
STRN3Q13033 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
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