Protein–RNA interactions for Protein: Q13011

ECH1, Delta(3,5)-Delta(2,4)-dienoyl-CoA isomerase, mitochondrial, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECH1Q13011 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms