Protein–RNA interactions for Protein: Q12906

ILF3, Interleukin enhancer-binding factor 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILF3Q12906 CENPK-208ENST00000508421 1586 ntTSL 3 BASIC8.01□□□□□ -1.137e-8■■■□□ 17.2
ILF3Q12906 CENPK-211ENST00000510693 1040 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.367e-8■■■□□ 17.2
ILF3Q12906 CENPK-201ENST00000242872 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.767e-8■■■□□ 17.2
ILF3Q12906 BUB1B-207ENST00000559414 526 ntTSL 412.53□□□□□ -0.43e-7■■■□□ 17.2
ILF3Q12906 BUB1B-211ENST00000560120 583 ntTSL 312.49□□□□□ -0.413e-7■■■□□ 17.2
ILF3Q12906 BUB1B-202ENST00000412359 3628 ntTSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.093e-7■■■□□ 17.2
ILF3Q12906 BUB1B-201ENST00000287598 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.13e-7■■■□□ 17.2
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ILF3Q12906 ANXA4-201ENST00000394295 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.592e-7■■■□□ 17.2
ILF3Q12906 ANXA4-205ENST00000460942 576 ntTSL 511.35□□□□□ -0.592e-7■■■□□ 17.2
ILF3Q12906 ANXA4-209ENST00000477632 3949 ntTSL 1 (best)8.21□□□□□ -1.12e-7■■■□□ 17.2
ILF3Q12906 ANXA4-203ENST00000418066 905 ntTSL 36.28□□□□□ -1.42e-7■■■□□ 17.2
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ILF3Q12906 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.071e-7■■■□□ 17.2
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ILF3Q12906 RBMS1-211ENST00000477486 562 ntTSL 421.99■■□□□ 1.112e-6■■■□□ 17.2
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ILF3Q12906 RBMS1-201ENST00000348849 4273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.382e-6■■■□□ 17.2
ILF3Q12906 RBMS1-209ENST00000474820 4016 ntTSL 1 (best)4.49□□□□□ -1.692e-6■■■□□ 17.2
ILF3Q12906 MAML2-201ENST00000524717 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.612e-6■■■□□ 17.2
ILF3Q12906 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.186e-7■■■□□ 17.1
ILF3Q12906 HECTD1-203ENST00000553700 9080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.296e-7■■■□□ 17.1
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ILF3Q12906 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.083e-6■■■□□ 17.1
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ILF3Q12906 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.063e-6■■■□□ 17.1
ILF3Q12906 WDR45-237ENST00000634908 560 ntTSL 415.28■□□□□ 0.043e-6■■■□□ 17.1
ILF3Q12906 ZMYND8-210ENST00000446894 341 ntTSL 23.49□□□□□ -1.855e-8■■■□□ 17.1
ILF3Q12906 ZMYND8-209ENST00000441977 175 ntTSL 30.4□□□□□ -2.355e-8■■■□□ 17.1
ILF3Q12906 ADGRG6-205ENST00000415128 1610 ntTSL 219.43■□□□□ 0.72e-7■■■□□ 17.1
ILF3Q12906 ADGRG6-214ENST00000545477 657 ntTSL 511.38□□□□□ -0.592e-7■■■□□ 17.1
ILF3Q12906 ADGRG6-206ENST00000435011 540 ntTSL 411.32□□□□□ -0.62e-7■■■□□ 17.1
ILF3Q12906 ADGRG6-213ENST00000541199 844 ntTSL 47.25□□□□□ -1.252e-7■■■□□ 17.1
ILF3Q12906 USP34-201ENST00000398571 11357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.731e-6■■■□□ 17.1
ILF3Q12906 HNRNPC-228ENST00000557033 760 ntTSL 39.74□□□□□ -0.855e-16■■■□□ 17
ILF3Q12906 HNRNPC-215ENST00000555127 929 ntTSL 26.42□□□□□ -1.385e-16■■■□□ 17
ILF3Q12906 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.273e-7■■■□□ 17
ILF3Q12906 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.013e-7■■■□□ 17
ILF3Q12906 NCOA6-201ENST00000359003 7081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.743e-7■■■□□ 17
ILF3Q12906 MSH6-211ENST00000606499 833 ntTSL 37.54□□□□□ -1.23e-7■■■□□ 17
ILF3Q12906 NCOA6-202ENST00000374796 9311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.323e-7■■■□□ 17
ILF3Q12906 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.067e-7■■■□□ 17
ILF3Q12906 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.727e-7■■■□□ 17
ILF3Q12906 AGAP1-214ENST00000635100 2478 ntTSL 514.1□□□□□ -0.157e-7■■■□□ 17
ILF3Q12906 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.217e-7■■■□□ 17
ILF3Q12906 NASP-210ENST00000481782 3659 ntTSL 26.99□□□□□ -1.291e-6■■■□□ 17
ILF3Q12906 IGF2BP1-201ENST00000290341 8274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.291e-7■■■□□ 17
ILF3Q12906 KPNB1-201ENST00000290158 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.828e-8■■■□□ 17
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