Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC173Q0VFZ6 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC173Q0VFZ6 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC173Q0VFZ6 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC173Q0VFZ6 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC173Q0VFZ6 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC173Q0VFZ6 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC173Q0VFZ6 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC173Q0VFZ6 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC173Q0VFZ6 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC173Q0VFZ6 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC173Q0VFZ6 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC173Q0VFZ6 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC173Q0VFZ6 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC173Q0VFZ6 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC173Q0VFZ6 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC173Q0VFZ6 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC173Q0VFZ6 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC173Q0VFZ6 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC173Q0VFZ6 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC173Q0VFZ6 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC173Q0VFZ6 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC173Q0VFZ6 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC173Q0VFZ6 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC173Q0VFZ6 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC173Q0VFZ6 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC173Q0VFZ6 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC173Q0VFZ6 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC173Q0VFZ6 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC173Q0VFZ6 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC173Q0VFZ6 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC173Q0VFZ6 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC173Q0VFZ6 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC173Q0VFZ6 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC173Q0VFZ6 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC173Q0VFZ6 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC173Q0VFZ6 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC173Q0VFZ6 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC173Q0VFZ6 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC173Q0VFZ6 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC173Q0VFZ6 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC173Q0VFZ6 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC173Q0VFZ6 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC173Q0VFZ6 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC173Q0VFZ6 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC173Q0VFZ6 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC173Q0VFZ6 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC173Q0VFZ6 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC173Q0VFZ6 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC173Q0VFZ6 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC173Q0VFZ6 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC173Q0VFZ6 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC173Q0VFZ6 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC173Q0VFZ6 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC173Q0VFZ6 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC173Q0VFZ6 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC173Q0VFZ6 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC173Q0VFZ6 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC173Q0VFZ6 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC173Q0VFZ6 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC173Q0VFZ6 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC173Q0VFZ6 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC173Q0VFZ6 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC173Q0VFZ6 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC173Q0VFZ6 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC173Q0VFZ6 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC173Q0VFZ6 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC173Q0VFZ6 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC173Q0VFZ6 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC173Q0VFZ6 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC173Q0VFZ6 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC173Q0VFZ6 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC173Q0VFZ6 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC173Q0VFZ6 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC173Q0VFZ6 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC173Q0VFZ6 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC173Q0VFZ6 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC173Q0VFZ6 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC173Q0VFZ6 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC173Q0VFZ6 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC173Q0VFZ6 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC173Q0VFZ6 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC173Q0VFZ6 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC173Q0VFZ6 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC173Q0VFZ6 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC173Q0VFZ6 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC173Q0VFZ6 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC173Q0VFZ6 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC173Q0VFZ6 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC173Q0VFZ6 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC173Q0VFZ6 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC173Q0VFZ6 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC173Q0VFZ6 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC173Q0VFZ6 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC173Q0VFZ6 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC173Q0VFZ6 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC173Q0VFZ6 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC173Q0VFZ6 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC173Q0VFZ6 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC173Q0VFZ6 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms