Protein–RNA interactions for Protein: Q02880

TOP2B, DNA topoisomerase 2-beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2BQ02880 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
TOP2BQ02880 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
TOP2BQ02880 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
TOP2BQ02880 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
TOP2BQ02880 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
TOP2BQ02880 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
TOP2BQ02880 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
TOP2BQ02880 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
TOP2BQ02880 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
TOP2BQ02880 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
TOP2BQ02880 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
TOP2BQ02880 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
TOP2BQ02880 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
TOP2BQ02880 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
TOP2BQ02880 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
TOP2BQ02880 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
TOP2BQ02880 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
TOP2BQ02880 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
TOP2BQ02880 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
TOP2BQ02880 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
TOP2BQ02880 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
TOP2BQ02880 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
TOP2BQ02880 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
TOP2BQ02880 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
TOP2BQ02880 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
TOP2BQ02880 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
TOP2BQ02880 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
TOP2BQ02880 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
TOP2BQ02880 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
TOP2BQ02880 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
TOP2BQ02880 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
TOP2BQ02880 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
TOP2BQ02880 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
TOP2BQ02880 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
TOP2BQ02880 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
TOP2BQ02880 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
TOP2BQ02880 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
TOP2BQ02880 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
TOP2BQ02880 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
TOP2BQ02880 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
TOP2BQ02880 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
TOP2BQ02880 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
TOP2BQ02880 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
TOP2BQ02880 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
TOP2BQ02880 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
TOP2BQ02880 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
TOP2BQ02880 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC32.33■■■□□ 2.77
TOP2BQ02880 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
TOP2BQ02880 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
TOP2BQ02880 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
TOP2BQ02880 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
TOP2BQ02880 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
TOP2BQ02880 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
TOP2BQ02880 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
TOP2BQ02880 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
TOP2BQ02880 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
TOP2BQ02880 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
TOP2BQ02880 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
TOP2BQ02880 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
TOP2BQ02880 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC32.32■■■□□ 2.76
TOP2BQ02880 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
TOP2BQ02880 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
TOP2BQ02880 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
TOP2BQ02880 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
TOP2BQ02880 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
TOP2BQ02880 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
TOP2BQ02880 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
TOP2BQ02880 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
TOP2BQ02880 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
TOP2BQ02880 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
TOP2BQ02880 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
TOP2BQ02880 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
TOP2BQ02880 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
TOP2BQ02880 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
TOP2BQ02880 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
TOP2BQ02880 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
TOP2BQ02880 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
TOP2BQ02880 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
TOP2BQ02880 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
TOP2BQ02880 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
TOP2BQ02880 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
TOP2BQ02880 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
TOP2BQ02880 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
TOP2BQ02880 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
TOP2BQ02880 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
TOP2BQ02880 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
TOP2BQ02880 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
TOP2BQ02880 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
TOP2BQ02880 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
TOP2BQ02880 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
TOP2BQ02880 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
TOP2BQ02880 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
TOP2BQ02880 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
TOP2BQ02880 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
TOP2BQ02880 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
TOP2BQ02880 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
TOP2BQ02880 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
TOP2BQ02880 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC32.28■■■□□ 2.76
TOP2BQ02880 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC32.28■■■□□ 2.76
TOP2BQ02880 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms