Protein–RNA interactions for Protein: Q02318

CYP27A1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP27A1Q02318 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CYP27A1Q02318 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CYP27A1Q02318 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CYP27A1Q02318 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CYP27A1Q02318 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CYP27A1Q02318 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CYP27A1Q02318 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CYP27A1Q02318 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CYP27A1Q02318 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CYP27A1Q02318 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CYP27A1Q02318 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CYP27A1Q02318 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CYP27A1Q02318 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CYP27A1Q02318 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CYP27A1Q02318 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CYP27A1Q02318 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CYP27A1Q02318 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CYP27A1Q02318 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CYP27A1Q02318 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CYP27A1Q02318 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CYP27A1Q02318 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CYP27A1Q02318 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CYP27A1Q02318 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CYP27A1Q02318 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CYP27A1Q02318 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CYP27A1Q02318 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CYP27A1Q02318 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CYP27A1Q02318 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CYP27A1Q02318 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CYP27A1Q02318 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CYP27A1Q02318 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CYP27A1Q02318 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CYP27A1Q02318 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CYP27A1Q02318 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CYP27A1Q02318 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CYP27A1Q02318 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CYP27A1Q02318 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CYP27A1Q02318 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CYP27A1Q02318 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CYP27A1Q02318 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CYP27A1Q02318 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CYP27A1Q02318 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CYP27A1Q02318 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CYP27A1Q02318 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CYP27A1Q02318 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CYP27A1Q02318 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CYP27A1Q02318 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CYP27A1Q02318 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CYP27A1Q02318 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CYP27A1Q02318 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CYP27A1Q02318 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CYP27A1Q02318 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CYP27A1Q02318 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CYP27A1Q02318 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CYP27A1Q02318 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CYP27A1Q02318 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CYP27A1Q02318 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CYP27A1Q02318 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CYP27A1Q02318 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CYP27A1Q02318 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CYP27A1Q02318 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CYP27A1Q02318 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CYP27A1Q02318 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CYP27A1Q02318 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CYP27A1Q02318 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CYP27A1Q02318 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CYP27A1Q02318 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CYP27A1Q02318 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CYP27A1Q02318 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CYP27A1Q02318 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CYP27A1Q02318 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CYP27A1Q02318 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CYP27A1Q02318 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CYP27A1Q02318 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CYP27A1Q02318 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CYP27A1Q02318 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CYP27A1Q02318 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CYP27A1Q02318 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CYP27A1Q02318 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CYP27A1Q02318 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CYP27A1Q02318 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CYP27A1Q02318 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CYP27A1Q02318 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CYP27A1Q02318 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CYP27A1Q02318 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CYP27A1Q02318 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CYP27A1Q02318 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CYP27A1Q02318 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CYP27A1Q02318 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CYP27A1Q02318 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CYP27A1Q02318 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CYP27A1Q02318 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CYP27A1Q02318 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CYP27A1Q02318 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CYP27A1Q02318 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CYP27A1Q02318 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CYP27A1Q02318 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CYP27A1Q02318 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CYP27A1Q02318 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CYP27A1Q02318 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms