Protein–RNA interactions for Protein: Q00994

BEX3, Protein BEX3, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEX3Q00994 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BEX3Q00994 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BEX3Q00994 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BEX3Q00994 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BEX3Q00994 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BEX3Q00994 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BEX3Q00994 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BEX3Q00994 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BEX3Q00994 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BEX3Q00994 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
BEX3Q00994 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
BEX3Q00994 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BEX3Q00994 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BEX3Q00994 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BEX3Q00994 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BEX3Q00994 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BEX3Q00994 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BEX3Q00994 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BEX3Q00994 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BEX3Q00994 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BEX3Q00994 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BEX3Q00994 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BEX3Q00994 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BEX3Q00994 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BEX3Q00994 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BEX3Q00994 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BEX3Q00994 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BEX3Q00994 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BEX3Q00994 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BEX3Q00994 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BEX3Q00994 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BEX3Q00994 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BEX3Q00994 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BEX3Q00994 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BEX3Q00994 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BEX3Q00994 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BEX3Q00994 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BEX3Q00994 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BEX3Q00994 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BEX3Q00994 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BEX3Q00994 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BEX3Q00994 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BEX3Q00994 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BEX3Q00994 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BEX3Q00994 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BEX3Q00994 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BEX3Q00994 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
BEX3Q00994 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
BEX3Q00994 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BEX3Q00994 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BEX3Q00994 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BEX3Q00994 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BEX3Q00994 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BEX3Q00994 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BEX3Q00994 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BEX3Q00994 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BEX3Q00994 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BEX3Q00994 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BEX3Q00994 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BEX3Q00994 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BEX3Q00994 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BEX3Q00994 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
BEX3Q00994 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BEX3Q00994 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
BEX3Q00994 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BEX3Q00994 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BEX3Q00994 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
BEX3Q00994 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BEX3Q00994 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BEX3Q00994 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BEX3Q00994 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BEX3Q00994 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BEX3Q00994 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BEX3Q00994 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BEX3Q00994 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BEX3Q00994 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BEX3Q00994 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
BEX3Q00994 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BEX3Q00994 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BEX3Q00994 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BEX3Q00994 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BEX3Q00994 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BEX3Q00994 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BEX3Q00994 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BEX3Q00994 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BEX3Q00994 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BEX3Q00994 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BEX3Q00994 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BEX3Q00994 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BEX3Q00994 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BEX3Q00994 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BEX3Q00994 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BEX3Q00994 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BEX3Q00994 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BEX3Q00994 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BEX3Q00994 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BEX3Q00994 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BEX3Q00994 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BEX3Q00994 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BEX3Q00994 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms