Protein–RNA interactions for Protein: P68133

ACTA1, Actin, alpha skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA1P68133 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACTA1P68133 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms