Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
RPS29P62273 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
RPS29P62273 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
RPS29P62273 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
RPS29P62273 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
RPS29P62273 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
RPS29P62273 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
RPS29P62273 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
RPS29P62273 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RPS29P62273 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RPS29P62273 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RPS29P62273 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RPS29P62273 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RPS29P62273 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RPS29P62273 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RPS29P62273 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RPS29P62273 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RPS29P62273 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RPS29P62273 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RPS29P62273 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RPS29P62273 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RPS29P62273 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RPS29P62273 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RPS29P62273 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RPS29P62273 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RPS29P62273 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RPS29P62273 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RPS29P62273 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RPS29P62273 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RPS29P62273 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RPS29P62273 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RPS29P62273 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RPS29P62273 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
RPS29P62273 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RPS29P62273 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RPS29P62273 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RPS29P62273 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
RPS29P62273 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
RPS29P62273 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
RPS29P62273 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RPS29P62273 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RPS29P62273 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RPS29P62273 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RPS29P62273 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RPS29P62273 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RPS29P62273 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RPS29P62273 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RPS29P62273 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RPS29P62273 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RPS29P62273 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RPS29P62273 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RPS29P62273 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RPS29P62273 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RPS29P62273 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RPS29P62273 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RPS29P62273 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RPS29P62273 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RPS29P62273 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RPS29P62273 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RPS29P62273 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RPS29P62273 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RPS29P62273 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RPS29P62273 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RPS29P62273 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
RPS29P62273 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RPS29P62273 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
RPS29P62273 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RPS29P62273 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RPS29P62273 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
RPS29P62273 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
RPS29P62273 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RPS29P62273 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
RPS29P62273 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RPS29P62273 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
RPS29P62273 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RPS29P62273 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RPS29P62273 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RPS29P62273 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RPS29P62273 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
RPS29P62273 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC11□□□□□ -0.65
RPS29P62273 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
RPS29P62273 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC11□□□□□ -0.65
RPS29P62273 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC11□□□□□ -0.65
RPS29P62273 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC11□□□□□ -0.65
RPS29P62273 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RPS29P62273 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
RPS29P62273 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
RPS29P62273 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC11□□□□□ -0.65
RPS29P62273 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
RPS29P62273 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
RPS29P62273 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RPS29P62273 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RPS29P62273 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
RPS29P62273 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC11□□□□□ -0.65
RPS29P62273 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RPS29P62273 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
RPS29P62273 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
RPS29P62273 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RPS29P62273 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RPS29P62273 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
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