Protein–RNA interactions for Protein: P60510

PPP4C, Serine/threonine-protein phosphatase 4 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4CP60510 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPP4CP60510 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPP4CP60510 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPP4CP60510 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPP4CP60510 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPP4CP60510 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPP4CP60510 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPP4CP60510 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPP4CP60510 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PPP4CP60510 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PPP4CP60510 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPP4CP60510 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PPP4CP60510 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPP4CP60510 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPP4CP60510 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPP4CP60510 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPP4CP60510 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPP4CP60510 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPP4CP60510 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPP4CP60510 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPP4CP60510 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPP4CP60510 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPP4CP60510 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPP4CP60510 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPP4CP60510 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPP4CP60510 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPP4CP60510 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPP4CP60510 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPP4CP60510 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPP4CP60510 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPP4CP60510 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPP4CP60510 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPP4CP60510 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPP4CP60510 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPP4CP60510 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPP4CP60510 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPP4CP60510 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPP4CP60510 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPP4CP60510 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPP4CP60510 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPP4CP60510 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPP4CP60510 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPP4CP60510 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPP4CP60510 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPP4CP60510 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPP4CP60510 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPP4CP60510 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPP4CP60510 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPP4CP60510 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPP4CP60510 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPP4CP60510 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PPP4CP60510 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPP4CP60510 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPP4CP60510 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPP4CP60510 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPP4CP60510 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPP4CP60510 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPP4CP60510 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPP4CP60510 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPP4CP60510 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPP4CP60510 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPP4CP60510 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPP4CP60510 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPP4CP60510 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPP4CP60510 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPP4CP60510 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPP4CP60510 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPP4CP60510 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPP4CP60510 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPP4CP60510 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPP4CP60510 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPP4CP60510 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPP4CP60510 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPP4CP60510 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPP4CP60510 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PPP4CP60510 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPP4CP60510 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPP4CP60510 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPP4CP60510 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPP4CP60510 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPP4CP60510 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPP4CP60510 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPP4CP60510 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPP4CP60510 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPP4CP60510 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPP4CP60510 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPP4CP60510 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PPP4CP60510 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPP4CP60510 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPP4CP60510 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPP4CP60510 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPP4CP60510 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPP4CP60510 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPP4CP60510 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPP4CP60510 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPP4CP60510 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPP4CP60510 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPP4CP60510 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPP4CP60510 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPP4CP60510 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms