Protein–RNA interactions for Protein: P60508

ERVFRD-1, Syncytin-2, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFRD-1P60508 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVFRD-1P60508 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms