Protein–RNA interactions for Protein: P52798

EFNA4, Ephrin-A4, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA4P52798 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNA4P52798 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms