Protein–RNA interactions for Protein: P51884

LUM, Lumican, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LUMP51884 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LUMP51884 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LUMP51884 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LUMP51884 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LUMP51884 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LUMP51884 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LUMP51884 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LUMP51884 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LUMP51884 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LUMP51884 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LUMP51884 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
LUMP51884 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
LUMP51884 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
LUMP51884 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LUMP51884 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LUMP51884 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LUMP51884 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
LUMP51884 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LUMP51884 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LUMP51884 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LUMP51884 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LUMP51884 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LUMP51884 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LUMP51884 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LUMP51884 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
LUMP51884 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LUMP51884 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LUMP51884 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LUMP51884 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LUMP51884 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LUMP51884 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LUMP51884 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LUMP51884 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LUMP51884 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LUMP51884 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LUMP51884 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LUMP51884 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LUMP51884 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LUMP51884 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LUMP51884 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LUMP51884 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LUMP51884 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LUMP51884 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
LUMP51884 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
LUMP51884 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LUMP51884 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LUMP51884 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LUMP51884 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LUMP51884 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LUMP51884 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LUMP51884 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LUMP51884 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LUMP51884 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LUMP51884 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LUMP51884 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LUMP51884 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LUMP51884 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LUMP51884 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LUMP51884 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LUMP51884 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LUMP51884 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LUMP51884 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LUMP51884 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LUMP51884 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LUMP51884 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LUMP51884 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LUMP51884 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LUMP51884 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LUMP51884 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LUMP51884 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LUMP51884 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LUMP51884 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LUMP51884 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LUMP51884 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LUMP51884 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LUMP51884 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LUMP51884 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LUMP51884 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LUMP51884 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LUMP51884 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LUMP51884 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LUMP51884 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LUMP51884 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LUMP51884 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LUMP51884 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LUMP51884 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LUMP51884 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LUMP51884 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LUMP51884 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LUMP51884 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LUMP51884 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LUMP51884 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LUMP51884 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LUMP51884 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LUMP51884 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LUMP51884 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LUMP51884 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LUMP51884 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LUMP51884 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LUMP51884 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms