Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PIK3CBP42338 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PIK3CBP42338 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PIK3CBP42338 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PIK3CBP42338 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PIK3CBP42338 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PIK3CBP42338 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PIK3CBP42338 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PIK3CBP42338 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PIK3CBP42338 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PIK3CBP42338 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PIK3CBP42338 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PIK3CBP42338 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PIK3CBP42338 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PIK3CBP42338 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PIK3CBP42338 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PIK3CBP42338 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PIK3CBP42338 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PIK3CBP42338 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PIK3CBP42338 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PIK3CBP42338 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PIK3CBP42338 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PIK3CBP42338 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PIK3CBP42338 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PIK3CBP42338 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PIK3CBP42338 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PIK3CBP42338 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PIK3CBP42338 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PIK3CBP42338 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PIK3CBP42338 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PIK3CBP42338 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PIK3CBP42338 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PIK3CBP42338 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PIK3CBP42338 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PIK3CBP42338 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PIK3CBP42338 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PIK3CBP42338 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PIK3CBP42338 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PIK3CBP42338 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PIK3CBP42338 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PIK3CBP42338 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PIK3CBP42338 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PIK3CBP42338 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PIK3CBP42338 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PIK3CBP42338 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PIK3CBP42338 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PIK3CBP42338 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PIK3CBP42338 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PIK3CBP42338 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PIK3CBP42338 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PIK3CBP42338 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PIK3CBP42338 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PIK3CBP42338 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PIK3CBP42338 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PIK3CBP42338 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PIK3CBP42338 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PIK3CBP42338 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PIK3CBP42338 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PIK3CBP42338 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PIK3CBP42338 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PIK3CBP42338 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PIK3CBP42338 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PIK3CBP42338 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PIK3CBP42338 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PIK3CBP42338 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PIK3CBP42338 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PIK3CBP42338 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PIK3CBP42338 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PIK3CBP42338 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PIK3CBP42338 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PIK3CBP42338 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PIK3CBP42338 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PIK3CBP42338 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PIK3CBP42338 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PIK3CBP42338 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PIK3CBP42338 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PIK3CBP42338 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PIK3CBP42338 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PIK3CBP42338 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PIK3CBP42338 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PIK3CBP42338 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PIK3CBP42338 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PIK3CBP42338 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PIK3CBP42338 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PIK3CBP42338 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PIK3CBP42338 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PIK3CBP42338 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PIK3CBP42338 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PIK3CBP42338 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PIK3CBP42338 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PIK3CBP42338 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PIK3CBP42338 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PIK3CBP42338 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PIK3CBP42338 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PIK3CBP42338 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PIK3CBP42338 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PIK3CBP42338 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PIK3CBP42338 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PIK3CBP42338 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PIK3CBP42338 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms