Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
FDFT1P37268 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
FDFT1P37268 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
FDFT1P37268 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
FDFT1P37268 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
FDFT1P37268 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
FDFT1P37268 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
FDFT1P37268 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
FDFT1P37268 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
FDFT1P37268 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
FDFT1P37268 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
FDFT1P37268 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
FDFT1P37268 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
FDFT1P37268 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
FDFT1P37268 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
FDFT1P37268 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
FDFT1P37268 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
FDFT1P37268 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
FDFT1P37268 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
FDFT1P37268 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
FDFT1P37268 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
FDFT1P37268 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
FDFT1P37268 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
FDFT1P37268 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
FDFT1P37268 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
FDFT1P37268 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
FDFT1P37268 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
FDFT1P37268 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
FDFT1P37268 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
FDFT1P37268 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
FDFT1P37268 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
FDFT1P37268 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
FDFT1P37268 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
FDFT1P37268 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
FDFT1P37268 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
FDFT1P37268 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
FDFT1P37268 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
FDFT1P37268 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
FDFT1P37268 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
FDFT1P37268 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
FDFT1P37268 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
FDFT1P37268 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
FDFT1P37268 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
FDFT1P37268 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
FDFT1P37268 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
FDFT1P37268 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
FDFT1P37268 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
FDFT1P37268 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
FDFT1P37268 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
FDFT1P37268 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
FDFT1P37268 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
FDFT1P37268 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
FDFT1P37268 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
FDFT1P37268 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
FDFT1P37268 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
FDFT1P37268 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
FDFT1P37268 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
FDFT1P37268 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
FDFT1P37268 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
FDFT1P37268 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
FDFT1P37268 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
FDFT1P37268 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FDFT1P37268 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
FDFT1P37268 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
FDFT1P37268 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FDFT1P37268 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FDFT1P37268 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FDFT1P37268 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FDFT1P37268 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FDFT1P37268 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
FDFT1P37268 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
FDFT1P37268 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
FDFT1P37268 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
FDFT1P37268 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
FDFT1P37268 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FDFT1P37268 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
FDFT1P37268 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
FDFT1P37268 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
FDFT1P37268 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
FDFT1P37268 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
FDFT1P37268 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FDFT1P37268 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FDFT1P37268 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FDFT1P37268 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
FDFT1P37268 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
FDFT1P37268 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
FDFT1P37268 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
FDFT1P37268 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
FDFT1P37268 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
FDFT1P37268 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
FDFT1P37268 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
FDFT1P37268 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
FDFT1P37268 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
FDFT1P37268 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
FDFT1P37268 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
FDFT1P37268 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
FDFT1P37268 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
FDFT1P37268 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
FDFT1P37268 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
FDFT1P37268 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms