Protein–RNA interactions for Protein: P37198

NUP62, Nuclear pore glycoprotein p62, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP62P37198 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP62P37198 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP62P37198 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP62P37198 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP62P37198 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP62P37198 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP62P37198 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP62P37198 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP62P37198 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP62P37198 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP62P37198 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP62P37198 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP62P37198 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP62P37198 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP62P37198 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP62P37198 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP62P37198 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP62P37198 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP62P37198 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP62P37198 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP62P37198 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP62P37198 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP62P37198 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP62P37198 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP62P37198 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP62P37198 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP62P37198 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP62P37198 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP62P37198 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP62P37198 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP62P37198 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP62P37198 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP62P37198 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP62P37198 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP62P37198 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP62P37198 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP62P37198 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP62P37198 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP62P37198 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP62P37198 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP62P37198 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP62P37198 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP62P37198 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP62P37198 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP62P37198 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP62P37198 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP62P37198 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP62P37198 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP62P37198 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP62P37198 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP62P37198 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP62P37198 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP62P37198 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP62P37198 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP62P37198 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP62P37198 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP62P37198 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP62P37198 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP62P37198 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP62P37198 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP62P37198 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP62P37198 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP62P37198 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP62P37198 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP62P37198 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP62P37198 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP62P37198 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP62P37198 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP62P37198 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP62P37198 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP62P37198 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP62P37198 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP62P37198 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP62P37198 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP62P37198 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP62P37198 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP62P37198 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP62P37198 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP62P37198 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP62P37198 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP62P37198 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP62P37198 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP62P37198 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP62P37198 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NUP62P37198 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NUP62P37198 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NUP62P37198 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NUP62P37198 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NUP62P37198 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NUP62P37198 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NUP62P37198 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
NUP62P37198 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NUP62P37198 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NUP62P37198 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NUP62P37198 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NUP62P37198 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NUP62P37198 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NUP62P37198 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NUP62P37198 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NUP62P37198 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms