Protein–RNA interactions for Protein: P36405

ARL3, ADP-ribosylation factor-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL3P36405 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ARL3P36405 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARL3P36405 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARL3P36405 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARL3P36405 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARL3P36405 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARL3P36405 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARL3P36405 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARL3P36405 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARL3P36405 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ARL3P36405 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARL3P36405 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ARL3P36405 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARL3P36405 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARL3P36405 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARL3P36405 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ARL3P36405 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARL3P36405 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARL3P36405 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARL3P36405 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARL3P36405 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARL3P36405 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARL3P36405 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARL3P36405 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARL3P36405 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARL3P36405 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARL3P36405 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARL3P36405 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARL3P36405 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ARL3P36405 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARL3P36405 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARL3P36405 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARL3P36405 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARL3P36405 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARL3P36405 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARL3P36405 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARL3P36405 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARL3P36405 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARL3P36405 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARL3P36405 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARL3P36405 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARL3P36405 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARL3P36405 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARL3P36405 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARL3P36405 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARL3P36405 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARL3P36405 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARL3P36405 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARL3P36405 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARL3P36405 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ARL3P36405 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARL3P36405 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARL3P36405 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARL3P36405 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARL3P36405 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ARL3P36405 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARL3P36405 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARL3P36405 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARL3P36405 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARL3P36405 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARL3P36405 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARL3P36405 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARL3P36405 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARL3P36405 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARL3P36405 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARL3P36405 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARL3P36405 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARL3P36405 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARL3P36405 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARL3P36405 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARL3P36405 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARL3P36405 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARL3P36405 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARL3P36405 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARL3P36405 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARL3P36405 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARL3P36405 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARL3P36405 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARL3P36405 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARL3P36405 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARL3P36405 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARL3P36405 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARL3P36405 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARL3P36405 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARL3P36405 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARL3P36405 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARL3P36405 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARL3P36405 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARL3P36405 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARL3P36405 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARL3P36405 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARL3P36405 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARL3P36405 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARL3P36405 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ARL3P36405 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ARL3P36405 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ARL3P36405 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ARL3P36405 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ARL3P36405 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ARL3P36405 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms