Protein–RNA interactions for Protein: P34925

RYK, Tyrosine-protein kinase RYK, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYKP34925 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RYKP34925 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RYKP34925 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RYKP34925 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RYKP34925 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RYKP34925 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RYKP34925 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RYKP34925 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RYKP34925 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RYKP34925 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RYKP34925 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RYKP34925 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RYKP34925 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RYKP34925 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RYKP34925 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RYKP34925 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RYKP34925 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RYKP34925 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RYKP34925 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RYKP34925 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RYKP34925 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RYKP34925 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RYKP34925 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RYKP34925 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RYKP34925 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RYKP34925 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RYKP34925 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RYKP34925 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RYKP34925 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RYKP34925 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RYKP34925 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RYKP34925 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RYKP34925 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RYKP34925 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RYKP34925 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RYKP34925 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RYKP34925 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RYKP34925 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RYKP34925 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RYKP34925 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RYKP34925 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RYKP34925 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RYKP34925 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RYKP34925 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RYKP34925 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RYKP34925 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RYKP34925 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RYKP34925 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RYKP34925 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RYKP34925 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RYKP34925 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RYKP34925 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RYKP34925 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RYKP34925 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RYKP34925 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RYKP34925 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RYKP34925 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RYKP34925 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RYKP34925 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RYKP34925 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RYKP34925 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
RYKP34925 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RYKP34925 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RYKP34925 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RYKP34925 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RYKP34925 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RYKP34925 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RYKP34925 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RYKP34925 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RYKP34925 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RYKP34925 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RYKP34925 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RYKP34925 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RYKP34925 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RYKP34925 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RYKP34925 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RYKP34925 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RYKP34925 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RYKP34925 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RYKP34925 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RYKP34925 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RYKP34925 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RYKP34925 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RYKP34925 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RYKP34925 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RYKP34925 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RYKP34925 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RYKP34925 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RYKP34925 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RYKP34925 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RYKP34925 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RYKP34925 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RYKP34925 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RYKP34925 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RYKP34925 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RYKP34925 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RYKP34925 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RYKP34925 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RYKP34925 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RYKP34925 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms