Protein–RNA interactions for Protein: P33991

MCM4, DNA replication licensing factor MCM4, humanhuman

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM4P33991 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCM4P33991 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCM4P33991 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCM4P33991 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCM4P33991 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCM4P33991 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCM4P33991 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCM4P33991 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCM4P33991 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCM4P33991 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCM4P33991 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCM4P33991 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCM4P33991 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCM4P33991 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCM4P33991 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCM4P33991 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCM4P33991 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCM4P33991 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCM4P33991 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
MCM4P33991 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
MCM4P33991 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
MCM4P33991 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
MCM4P33991 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCM4P33991 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCM4P33991 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCM4P33991 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCM4P33991 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCM4P33991 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCM4P33991 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCM4P33991 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCM4P33991 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCM4P33991 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCM4P33991 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCM4P33991 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCM4P33991 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCM4P33991 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCM4P33991 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MCM4P33991 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCM4P33991 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCM4P33991 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCM4P33991 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MCM4P33991 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCM4P33991 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCM4P33991 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCM4P33991 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCM4P33991 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCM4P33991 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCM4P33991 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCM4P33991 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCM4P33991 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCM4P33991 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCM4P33991 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCM4P33991 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCM4P33991 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCM4P33991 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCM4P33991 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCM4P33991 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCM4P33991 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCM4P33991 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCM4P33991 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCM4P33991 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCM4P33991 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCM4P33991 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCM4P33991 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCM4P33991 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCM4P33991 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCM4P33991 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MCM4P33991 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCM4P33991 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCM4P33991 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCM4P33991 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCM4P33991 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MCM4P33991 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCM4P33991 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCM4P33991 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCM4P33991 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCM4P33991 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCM4P33991 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCM4P33991 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCM4P33991 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCM4P33991 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCM4P33991 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCM4P33991 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCM4P33991 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCM4P33991 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCM4P33991 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCM4P33991 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCM4P33991 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCM4P33991 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCM4P33991 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCM4P33991 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCM4P33991 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCM4P33991 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCM4P33991 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCM4P33991 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCM4P33991 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCM4P33991 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCM4P33991 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MCM4P33991 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCM4P33991 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms