Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 KC6-207ENST00000600644 2311 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms