Protein–RNA interactions for Protein: P20941

PDC, Phosducin, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCP20941 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDCP20941 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDCP20941 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDCP20941 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDCP20941 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDCP20941 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDCP20941 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PDCP20941 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDCP20941 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDCP20941 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDCP20941 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDCP20941 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDCP20941 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDCP20941 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PDCP20941 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDCP20941 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDCP20941 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDCP20941 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDCP20941 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDCP20941 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDCP20941 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDCP20941 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDCP20941 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDCP20941 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDCP20941 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDCP20941 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDCP20941 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDCP20941 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDCP20941 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDCP20941 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDCP20941 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDCP20941 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PDCP20941 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDCP20941 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDCP20941 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDCP20941 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDCP20941 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDCP20941 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDCP20941 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDCP20941 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDCP20941 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDCP20941 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDCP20941 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDCP20941 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDCP20941 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDCP20941 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDCP20941 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDCP20941 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDCP20941 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDCP20941 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDCP20941 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDCP20941 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDCP20941 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDCP20941 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDCP20941 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDCP20941 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PDCP20941 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDCP20941 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDCP20941 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDCP20941 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDCP20941 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDCP20941 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDCP20941 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDCP20941 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDCP20941 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDCP20941 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDCP20941 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDCP20941 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PDCP20941 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDCP20941 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDCP20941 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDCP20941 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDCP20941 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDCP20941 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDCP20941 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDCP20941 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDCP20941 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDCP20941 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDCP20941 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDCP20941 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDCP20941 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDCP20941 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDCP20941 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDCP20941 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDCP20941 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDCP20941 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDCP20941 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDCP20941 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDCP20941 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDCP20941 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDCP20941 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDCP20941 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDCP20941 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PDCP20941 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PDCP20941 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PDCP20941 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PDCP20941 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDCP20941 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDCP20941 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDCP20941 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms