Protein–RNA interactions for Protein: P20138

CD33, Myeloid cell surface antigen CD33, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD33P20138 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD33P20138 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD33P20138 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CD33P20138 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD33P20138 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD33P20138 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD33P20138 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD33P20138 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD33P20138 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD33P20138 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD33P20138 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD33P20138 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD33P20138 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD33P20138 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD33P20138 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD33P20138 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD33P20138 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD33P20138 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD33P20138 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD33P20138 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD33P20138 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CD33P20138 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD33P20138 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD33P20138 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD33P20138 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD33P20138 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD33P20138 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD33P20138 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD33P20138 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD33P20138 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD33P20138 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD33P20138 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD33P20138 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD33P20138 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD33P20138 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD33P20138 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD33P20138 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD33P20138 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD33P20138 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD33P20138 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD33P20138 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD33P20138 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD33P20138 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD33P20138 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD33P20138 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD33P20138 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD33P20138 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD33P20138 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD33P20138 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD33P20138 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD33P20138 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD33P20138 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD33P20138 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD33P20138 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD33P20138 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD33P20138 AL589935.2-201ENST00000616471 1231 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CD33P20138 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD33P20138 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD33P20138 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD33P20138 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CD33P20138 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CD33P20138 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CD33P20138 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CD33P20138 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CD33P20138 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD33P20138 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD33P20138 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD33P20138 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD33P20138 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD33P20138 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD33P20138 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD33P20138 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD33P20138 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD33P20138 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD33P20138 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD33P20138 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD33P20138 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD33P20138 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD33P20138 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD33P20138 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD33P20138 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD33P20138 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD33P20138 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD33P20138 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD33P20138 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD33P20138 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD33P20138 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD33P20138 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD33P20138 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD33P20138 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD33P20138 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD33P20138 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD33P20138 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD33P20138 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD33P20138 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD33P20138 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD33P20138 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD33P20138 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD33P20138 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD33P20138 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms