Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRAP18433 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRAP18433 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRAP18433 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRAP18433 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRAP18433 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRAP18433 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRAP18433 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRAP18433 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRAP18433 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRAP18433 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRAP18433 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRAP18433 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRAP18433 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRAP18433 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRAP18433 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRAP18433 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRAP18433 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRAP18433 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRAP18433 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRAP18433 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRAP18433 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRAP18433 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRAP18433 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRAP18433 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRAP18433 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRAP18433 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRAP18433 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRAP18433 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRAP18433 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRAP18433 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRAP18433 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRAP18433 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRAP18433 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRAP18433 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRAP18433 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRAP18433 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRAP18433 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRAP18433 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRAP18433 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRAP18433 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRAP18433 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRAP18433 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRAP18433 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRAP18433 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRAP18433 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRAP18433 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRAP18433 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRAP18433 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRAP18433 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRAP18433 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRAP18433 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRAP18433 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRAP18433 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRAP18433 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRAP18433 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRAP18433 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRAP18433 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRAP18433 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRAP18433 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRAP18433 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRAP18433 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRAP18433 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRAP18433 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRAP18433 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRAP18433 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRAP18433 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRAP18433 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRAP18433 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRAP18433 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRAP18433 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRAP18433 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRAP18433 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRAP18433 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRAP18433 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRAP18433 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRAP18433 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRAP18433 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRAP18433 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRAP18433 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRAP18433 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRAP18433 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRAP18433 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRAP18433 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRAP18433 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRAP18433 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRAP18433 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRAP18433 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRAP18433 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRAP18433 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRAP18433 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRAP18433 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRAP18433 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRAP18433 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRAP18433 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRAP18433 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRAP18433 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRAP18433 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRAP18433 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRAP18433 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
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