Protein–RNA interactions for Protein: P13056

NR2C1, Nuclear receptor subfamily 2 group C member 1, humanhuman

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2C1P13056 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NR2C1P13056 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NR2C1P13056 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NR2C1P13056 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NR2C1P13056 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NR2C1P13056 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NR2C1P13056 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NR2C1P13056 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NR2C1P13056 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NR2C1P13056 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NR2C1P13056 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NR2C1P13056 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NR2C1P13056 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NR2C1P13056 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NR2C1P13056 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NR2C1P13056 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NR2C1P13056 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NR2C1P13056 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NR2C1P13056 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NR2C1P13056 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NR2C1P13056 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NR2C1P13056 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NR2C1P13056 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NR2C1P13056 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NR2C1P13056 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NR2C1P13056 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NR2C1P13056 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NR2C1P13056 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NR2C1P13056 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NR2C1P13056 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NR2C1P13056 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NR2C1P13056 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NR2C1P13056 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NR2C1P13056 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NR2C1P13056 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NR2C1P13056 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NR2C1P13056 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NR2C1P13056 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NR2C1P13056 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NR2C1P13056 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NR2C1P13056 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NR2C1P13056 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NR2C1P13056 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NR2C1P13056 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NR2C1P13056 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NR2C1P13056 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NR2C1P13056 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
NR2C1P13056 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NR2C1P13056 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NR2C1P13056 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NR2C1P13056 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NR2C1P13056 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NR2C1P13056 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
NR2C1P13056 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NR2C1P13056 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NR2C1P13056 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NR2C1P13056 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NR2C1P13056 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NR2C1P13056 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NR2C1P13056 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NR2C1P13056 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NR2C1P13056 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NR2C1P13056 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NR2C1P13056 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NR2C1P13056 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NR2C1P13056 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
NR2C1P13056 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NR2C1P13056 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NR2C1P13056 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NR2C1P13056 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NR2C1P13056 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NR2C1P13056 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NR2C1P13056 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NR2C1P13056 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NR2C1P13056 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NR2C1P13056 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NR2C1P13056 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NR2C1P13056 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NR2C1P13056 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NR2C1P13056 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NR2C1P13056 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
NR2C1P13056 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
NR2C1P13056 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
NR2C1P13056 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
NR2C1P13056 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
NR2C1P13056 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NR2C1P13056 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NR2C1P13056 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NR2C1P13056 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NR2C1P13056 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NR2C1P13056 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NR2C1P13056 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NR2C1P13056 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NR2C1P13056 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NR2C1P13056 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NR2C1P13056 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NR2C1P13056 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NR2C1P13056 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NR2C1P13056 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NR2C1P13056 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms