Protein–RNA interactions for Protein: P12035

KRT3, Keratin, type II cytoskeletal 3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT3P12035 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KRT3P12035 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KRT3P12035 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KRT3P12035 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KRT3P12035 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KRT3P12035 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KRT3P12035 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KRT3P12035 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
KRT3P12035 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KRT3P12035 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KRT3P12035 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KRT3P12035 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KRT3P12035 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KRT3P12035 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KRT3P12035 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KRT3P12035 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KRT3P12035 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KRT3P12035 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KRT3P12035 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KRT3P12035 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KRT3P12035 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KRT3P12035 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KRT3P12035 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KRT3P12035 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KRT3P12035 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KRT3P12035 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
KRT3P12035 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KRT3P12035 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KRT3P12035 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KRT3P12035 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KRT3P12035 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KRT3P12035 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KRT3P12035 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KRT3P12035 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KRT3P12035 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KRT3P12035 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KRT3P12035 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KRT3P12035 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
KRT3P12035 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KRT3P12035 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KRT3P12035 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KRT3P12035 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KRT3P12035 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KRT3P12035 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KRT3P12035 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KRT3P12035 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KRT3P12035 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KRT3P12035 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KRT3P12035 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KRT3P12035 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KRT3P12035 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KRT3P12035 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KRT3P12035 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KRT3P12035 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KRT3P12035 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KRT3P12035 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KRT3P12035 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KRT3P12035 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KRT3P12035 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KRT3P12035 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KRT3P12035 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KRT3P12035 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KRT3P12035 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KRT3P12035 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KRT3P12035 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KRT3P12035 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KRT3P12035 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KRT3P12035 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KRT3P12035 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KRT3P12035 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KRT3P12035 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KRT3P12035 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
KRT3P12035 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KRT3P12035 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KRT3P12035 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KRT3P12035 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KRT3P12035 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KRT3P12035 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KRT3P12035 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KRT3P12035 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KRT3P12035 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KRT3P12035 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KRT3P12035 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KRT3P12035 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KRT3P12035 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KRT3P12035 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KRT3P12035 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KRT3P12035 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KRT3P12035 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KRT3P12035 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KRT3P12035 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
KRT3P12035 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KRT3P12035 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KRT3P12035 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KRT3P12035 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KRT3P12035 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KRT3P12035 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KRT3P12035 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KRT3P12035 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KRT3P12035 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms