Protein–RNA interactions for Protein: P0C875

FAM228B, Protein FAM228B, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM228BP0C875 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM228BP0C875 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM228BP0C875 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM228BP0C875 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM228BP0C875 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM228BP0C875 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM228BP0C875 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM228BP0C875 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM228BP0C875 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM228BP0C875 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM228BP0C875 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM228BP0C875 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM228BP0C875 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM228BP0C875 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM228BP0C875 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM228BP0C875 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM228BP0C875 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM228BP0C875 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM228BP0C875 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM228BP0C875 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM228BP0C875 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM228BP0C875 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM228BP0C875 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM228BP0C875 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM228BP0C875 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM228BP0C875 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM228BP0C875 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM228BP0C875 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM228BP0C875 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM228BP0C875 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM228BP0C875 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM228BP0C875 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM228BP0C875 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM228BP0C875 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM228BP0C875 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM228BP0C875 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM228BP0C875 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM228BP0C875 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM228BP0C875 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM228BP0C875 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM228BP0C875 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM228BP0C875 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM228BP0C875 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM228BP0C875 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM228BP0C875 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM228BP0C875 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM228BP0C875 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM228BP0C875 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM228BP0C875 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM228BP0C875 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM228BP0C875 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM228BP0C875 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM228BP0C875 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM228BP0C875 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM228BP0C875 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAM228BP0C875 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAM228BP0C875 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAM228BP0C875 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAM228BP0C875 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAM228BP0C875 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAM228BP0C875 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAM228BP0C875 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAM228BP0C875 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAM228BP0C875 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAM228BP0C875 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAM228BP0C875 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAM228BP0C875 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAM228BP0C875 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAM228BP0C875 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAM228BP0C875 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAM228BP0C875 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAM228BP0C875 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAM228BP0C875 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAM228BP0C875 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FAM228BP0C875 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FAM228BP0C875 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FAM228BP0C875 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FAM228BP0C875 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FAM228BP0C875 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FAM228BP0C875 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FAM228BP0C875 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FAM228BP0C875 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
FAM228BP0C875 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FAM228BP0C875 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
FAM228BP0C875 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FAM228BP0C875 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FAM228BP0C875 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FAM228BP0C875 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FAM228BP0C875 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FAM228BP0C875 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FAM228BP0C875 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FAM228BP0C875 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FAM228BP0C875 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FAM228BP0C875 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FAM228BP0C875 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FAM228BP0C875 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FAM228BP0C875 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FAM228BP0C875 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FAM228BP0C875 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FAM228BP0C875 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms