Protein–RNA interactions for Protein: P09629

HOXB7, Homeobox protein Hox-B7, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB7P09629 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXB7P09629 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXB7P09629 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXB7P09629 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXB7P09629 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXB7P09629 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXB7P09629 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXB7P09629 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXB7P09629 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXB7P09629 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXB7P09629 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXB7P09629 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HOXB7P09629 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HOXB7P09629 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HOXB7P09629 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HOXB7P09629 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HOXB7P09629 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HOXB7P09629 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HOXB7P09629 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HOXB7P09629 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
HOXB7P09629 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
HOXB7P09629 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HOXB7P09629 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HOXB7P09629 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HOXB7P09629 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HOXB7P09629 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HOXB7P09629 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HOXB7P09629 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HOXB7P09629 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXB7P09629 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXB7P09629 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXB7P09629 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXB7P09629 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXB7P09629 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXB7P09629 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXB7P09629 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXB7P09629 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXB7P09629 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXB7P09629 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXB7P09629 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXB7P09629 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXB7P09629 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXB7P09629 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXB7P09629 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXB7P09629 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXB7P09629 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXB7P09629 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXB7P09629 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXB7P09629 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXB7P09629 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXB7P09629 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXB7P09629 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXB7P09629 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXB7P09629 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXB7P09629 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXB7P09629 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXB7P09629 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXB7P09629 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXB7P09629 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXB7P09629 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXB7P09629 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXB7P09629 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXB7P09629 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXB7P09629 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXB7P09629 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXB7P09629 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXB7P09629 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXB7P09629 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXB7P09629 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXB7P09629 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXB7P09629 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXB7P09629 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXB7P09629 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXB7P09629 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXB7P09629 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXB7P09629 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXB7P09629 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXB7P09629 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXB7P09629 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXB7P09629 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXB7P09629 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXB7P09629 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXB7P09629 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXB7P09629 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXB7P09629 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXB7P09629 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXB7P09629 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXB7P09629 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXB7P09629 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXB7P09629 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXB7P09629 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXB7P09629 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXB7P09629 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXB7P09629 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXB7P09629 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXB7P09629 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXB7P09629 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXB7P09629 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXB7P09629 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXB7P09629 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms