Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

Predictions only

Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
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