Protein–RNA interactions for Protein: P00488

F13A1, Coagulation factor XIII A chain, humanhuman

Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13A1P00488 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
F13A1P00488 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
F13A1P00488 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
F13A1P00488 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
F13A1P00488 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
F13A1P00488 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
F13A1P00488 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
F13A1P00488 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
F13A1P00488 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
F13A1P00488 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
F13A1P00488 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
F13A1P00488 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
F13A1P00488 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
F13A1P00488 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
F13A1P00488 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
F13A1P00488 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
F13A1P00488 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
F13A1P00488 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
F13A1P00488 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
F13A1P00488 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
F13A1P00488 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
F13A1P00488 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
F13A1P00488 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
F13A1P00488 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
F13A1P00488 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
F13A1P00488 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
F13A1P00488 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
F13A1P00488 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
F13A1P00488 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
F13A1P00488 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
F13A1P00488 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
F13A1P00488 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
F13A1P00488 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
F13A1P00488 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
F13A1P00488 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
F13A1P00488 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
F13A1P00488 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
F13A1P00488 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
F13A1P00488 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
F13A1P00488 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
F13A1P00488 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
F13A1P00488 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
F13A1P00488 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
F13A1P00488 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
F13A1P00488 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
F13A1P00488 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
F13A1P00488 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
F13A1P00488 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
F13A1P00488 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
F13A1P00488 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
F13A1P00488 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
F13A1P00488 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
F13A1P00488 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
F13A1P00488 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
F13A1P00488 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
F13A1P00488 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
F13A1P00488 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
F13A1P00488 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
F13A1P00488 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
F13A1P00488 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
F13A1P00488 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
F13A1P00488 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
F13A1P00488 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
F13A1P00488 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
F13A1P00488 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
F13A1P00488 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
F13A1P00488 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
F13A1P00488 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
F13A1P00488 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
F13A1P00488 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
F13A1P00488 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
F13A1P00488 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
F13A1P00488 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
F13A1P00488 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
F13A1P00488 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
F13A1P00488 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
F13A1P00488 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
F13A1P00488 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
F13A1P00488 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
F13A1P00488 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
F13A1P00488 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
F13A1P00488 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
F13A1P00488 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
F13A1P00488 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
F13A1P00488 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
F13A1P00488 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
F13A1P00488 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
F13A1P00488 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
F13A1P00488 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
F13A1P00488 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
F13A1P00488 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
F13A1P00488 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
F13A1P00488 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
F13A1P00488 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
F13A1P00488 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
F13A1P00488 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
F13A1P00488 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
F13A1P00488 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
F13A1P00488 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
F13A1P00488 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms