Protein–RNA interactions for Protein: O95562

SFT2D2, Vesicle transport protein SFT2B, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D2O95562 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms