Protein–RNA interactions for Protein: O95243

MBD4, Methyl-CpG-binding domain protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD4O95243 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MBD4O95243 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MBD4O95243 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MBD4O95243 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MBD4O95243 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MBD4O95243 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MBD4O95243 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MBD4O95243 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MBD4O95243 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MBD4O95243 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MBD4O95243 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MBD4O95243 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MBD4O95243 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MBD4O95243 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MBD4O95243 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MBD4O95243 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MBD4O95243 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MBD4O95243 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MBD4O95243 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MBD4O95243 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MBD4O95243 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MBD4O95243 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
MBD4O95243 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MBD4O95243 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MBD4O95243 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MBD4O95243 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MBD4O95243 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MBD4O95243 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
MBD4O95243 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MBD4O95243 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MBD4O95243 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MBD4O95243 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MBD4O95243 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MBD4O95243 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MBD4O95243 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MBD4O95243 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MBD4O95243 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MBD4O95243 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MBD4O95243 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MBD4O95243 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MBD4O95243 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MBD4O95243 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MBD4O95243 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
MBD4O95243 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MBD4O95243 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MBD4O95243 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
MBD4O95243 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MBD4O95243 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
MBD4O95243 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MBD4O95243 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MBD4O95243 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MBD4O95243 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MBD4O95243 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MBD4O95243 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MBD4O95243 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MBD4O95243 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MBD4O95243 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
MBD4O95243 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MBD4O95243 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MBD4O95243 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MBD4O95243 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MBD4O95243 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MBD4O95243 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MBD4O95243 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MBD4O95243 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MBD4O95243 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MBD4O95243 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MBD4O95243 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MBD4O95243 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MBD4O95243 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
MBD4O95243 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MBD4O95243 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MBD4O95243 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MBD4O95243 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MBD4O95243 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MBD4O95243 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MBD4O95243 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MBD4O95243 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MBD4O95243 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MBD4O95243 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MBD4O95243 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MBD4O95243 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MBD4O95243 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MBD4O95243 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MBD4O95243 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MBD4O95243 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MBD4O95243 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MBD4O95243 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MBD4O95243 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MBD4O95243 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
MBD4O95243 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MBD4O95243 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MBD4O95243 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MBD4O95243 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MBD4O95243 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
MBD4O95243 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MBD4O95243 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MBD4O95243 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MBD4O95243 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MBD4O95243 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms