Protein–RNA interactions for Protein: O95045

UPP2, Uridine phosphorylase 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP2O95045 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UPP2O95045 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
UPP2O95045 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
UPP2O95045 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UPP2O95045 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
UPP2O95045 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UPP2O95045 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
UPP2O95045 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UPP2O95045 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UPP2O95045 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UPP2O95045 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UPP2O95045 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
UPP2O95045 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
UPP2O95045 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
UPP2O95045 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
UPP2O95045 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UPP2O95045 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UPP2O95045 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UPP2O95045 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UPP2O95045 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
UPP2O95045 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UPP2O95045 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UPP2O95045 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UPP2O95045 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UPP2O95045 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
UPP2O95045 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
UPP2O95045 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
UPP2O95045 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
UPP2O95045 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
UPP2O95045 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UPP2O95045 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
UPP2O95045 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UPP2O95045 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UPP2O95045 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
UPP2O95045 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
UPP2O95045 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UPP2O95045 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UPP2O95045 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
UPP2O95045 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
UPP2O95045 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
UPP2O95045 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
UPP2O95045 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UPP2O95045 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UPP2O95045 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UPP2O95045 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UPP2O95045 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UPP2O95045 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
UPP2O95045 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
UPP2O95045 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UPP2O95045 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UPP2O95045 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
UPP2O95045 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UPP2O95045 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
UPP2O95045 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
UPP2O95045 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
UPP2O95045 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
UPP2O95045 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
UPP2O95045 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
UPP2O95045 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
UPP2O95045 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UPP2O95045 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UPP2O95045 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
UPP2O95045 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UPP2O95045 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
UPP2O95045 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
UPP2O95045 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
UPP2O95045 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
UPP2O95045 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
UPP2O95045 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
UPP2O95045 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
UPP2O95045 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
UPP2O95045 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
UPP2O95045 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
UPP2O95045 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
UPP2O95045 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
UPP2O95045 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
UPP2O95045 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
UPP2O95045 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
UPP2O95045 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
UPP2O95045 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
UPP2O95045 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
UPP2O95045 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
UPP2O95045 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
UPP2O95045 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
UPP2O95045 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
UPP2O95045 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
UPP2O95045 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
UPP2O95045 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
UPP2O95045 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
UPP2O95045 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
UPP2O95045 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
UPP2O95045 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
UPP2O95045 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
UPP2O95045 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
UPP2O95045 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
UPP2O95045 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
UPP2O95045 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
UPP2O95045 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
UPP2O95045 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
UPP2O95045 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms