Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms