Protein–RNA interactions for Protein: O60260

PRKN, E3 ubiquitin-protein ligase parkin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKNO60260 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PRKNO60260 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRKNO60260 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRKNO60260 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRKNO60260 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRKNO60260 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRKNO60260 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRKNO60260 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRKNO60260 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRKNO60260 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRKNO60260 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRKNO60260 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PRKNO60260 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRKNO60260 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PRKNO60260 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRKNO60260 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRKNO60260 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRKNO60260 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PRKNO60260 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRKNO60260 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRKNO60260 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRKNO60260 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRKNO60260 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRKNO60260 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRKNO60260 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRKNO60260 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRKNO60260 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRKNO60260 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRKNO60260 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRKNO60260 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRKNO60260 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRKNO60260 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRKNO60260 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRKNO60260 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRKNO60260 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRKNO60260 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRKNO60260 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PRKNO60260 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRKNO60260 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRKNO60260 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRKNO60260 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PRKNO60260 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PRKNO60260 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PRKNO60260 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PRKNO60260 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRKNO60260 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
PRKNO60260 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRKNO60260 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PRKNO60260 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PRKNO60260 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PRKNO60260 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRKNO60260 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PRKNO60260 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PRKNO60260 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PRKNO60260 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PRKNO60260 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRKNO60260 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PRKNO60260 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRKNO60260 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRKNO60260 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRKNO60260 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRKNO60260 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRKNO60260 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRKNO60260 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRKNO60260 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRKNO60260 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRKNO60260 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRKNO60260 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRKNO60260 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRKNO60260 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRKNO60260 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRKNO60260 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRKNO60260 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRKNO60260 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRKNO60260 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRKNO60260 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRKNO60260 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRKNO60260 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRKNO60260 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRKNO60260 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRKNO60260 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRKNO60260 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRKNO60260 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRKNO60260 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRKNO60260 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRKNO60260 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRKNO60260 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRKNO60260 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRKNO60260 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRKNO60260 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRKNO60260 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRKNO60260 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRKNO60260 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRKNO60260 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRKNO60260 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRKNO60260 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRKNO60260 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRKNO60260 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRKNO60260 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PRKNO60260 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms