Protein–RNA interactions for Protein: O43921

EFNA2, Ephrin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA2O43921 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EFNA2O43921 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EFNA2O43921 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EFNA2O43921 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EFNA2O43921 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EFNA2O43921 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EFNA2O43921 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EFNA2O43921 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EFNA2O43921 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EFNA2O43921 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EFNA2O43921 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EFNA2O43921 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EFNA2O43921 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EFNA2O43921 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EFNA2O43921 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
EFNA2O43921 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EFNA2O43921 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
EFNA2O43921 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EFNA2O43921 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
EFNA2O43921 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
EFNA2O43921 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EFNA2O43921 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EFNA2O43921 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EFNA2O43921 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
EFNA2O43921 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
EFNA2O43921 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EFNA2O43921 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EFNA2O43921 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EFNA2O43921 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EFNA2O43921 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EFNA2O43921 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EFNA2O43921 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EFNA2O43921 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EFNA2O43921 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EFNA2O43921 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EFNA2O43921 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
EFNA2O43921 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EFNA2O43921 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EFNA2O43921 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EFNA2O43921 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EFNA2O43921 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EFNA2O43921 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EFNA2O43921 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EFNA2O43921 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EFNA2O43921 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EFNA2O43921 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EFNA2O43921 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EFNA2O43921 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
EFNA2O43921 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EFNA2O43921 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EFNA2O43921 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EFNA2O43921 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EFNA2O43921 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EFNA2O43921 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EFNA2O43921 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EFNA2O43921 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EFNA2O43921 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EFNA2O43921 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EFNA2O43921 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EFNA2O43921 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EFNA2O43921 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EFNA2O43921 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EFNA2O43921 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EFNA2O43921 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EFNA2O43921 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EFNA2O43921 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
EFNA2O43921 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EFNA2O43921 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
EFNA2O43921 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EFNA2O43921 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EFNA2O43921 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EFNA2O43921 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EFNA2O43921 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
EFNA2O43921 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EFNA2O43921 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EFNA2O43921 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EFNA2O43921 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EFNA2O43921 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EFNA2O43921 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EFNA2O43921 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EFNA2O43921 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EFNA2O43921 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EFNA2O43921 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EFNA2O43921 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EFNA2O43921 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EFNA2O43921 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EFNA2O43921 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EFNA2O43921 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EFNA2O43921 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EFNA2O43921 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EFNA2O43921 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EFNA2O43921 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EFNA2O43921 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EFNA2O43921 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EFNA2O43921 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EFNA2O43921 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EFNA2O43921 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
EFNA2O43921 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EFNA2O43921 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EFNA2O43921 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms